Главное место в работе Потсдамской конференции заняла проблема послевоенной Германии. Были согласованы основные принципы совместной политики к этой стране. Предусматривалось денацификация, демилитаризация, демократизация, децентрализация и декартелизация страны.
По решению Потсдамской конференции Пруссия была ликвидирована как государственное образование. Восточная Пруссия была разделена между Советским Союзом и Польшей. В состав Советского Союза вместе со столицей Кёнигсбергом вошла одна треть Восточной Пруссии, на территории которой была создана Калининградская область РСФСР. Небольшая часть, включавшая часть Куршской косы и город Клайпеда, была передана в 1950 году Литовской ССР.
Во время заседаний Гарри Трумэн получил знаменитое известие о создании американского ядерного оружия: «Ребёнок родился».
Берлинская (Потсдамская) конференция стала последней в ряду встреч лидеров Большой тройки, при этом руководители СССР, США и Великобритании не возражали на словах вновь встретиться в прежнем формате. Однако первая встреча глав СССР и США состоялась только в 1959 году во время визита советской делегации в Соединённые Штаты Америки.